No capto donde esta tu inquietud. El porcentaje es una parte de algo, se puede decir una fraccion, por eso seria bueno que representes el porcentaje con decimales y asi lo guardas.
Por ejemplo, el 80% lo guardas como 0.8. Cuando necesites saber cuantos es el porcentaje de un numero, digamos de 120, lo multiplicas por 0.8 y tendrás 96 que es el 80% de 120.
Sino es esto, tendrias que especificar un poco mas. Saludos